MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Accumulibacter phosphatis clade IIA str. UW-1 chromosome

Total Repeats: 124504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013194	TGC	2	6	6	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013194	CCG	2	6	28	33	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_013194	CAA	2	6	64	69	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013194	GTC	2	6	135	140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013194	TAA	2	6	167	172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013194	TGA	2	6	237	242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257091664
7	NC_013194	CAG	2	6	293	298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257091664
8	NC_013194	GAG	2	6	335	340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257091664
9	NC_013194	CTG	2	6	362	367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091664
10	NC_013194	TGGG	2	8	474	481	0 %	25 %	75 %	0 %	257091664
11	NC_013194	CGC	2	6	484	489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257091664
12	NC_013194	CGG	2	6	552	557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257091664
13	NC_013194	GAA	2	6	595	600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257091664
14	NC_013194	TGG	2	6	609	614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257091664
15	NC_013194	CGC	2	6	706	711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257091664
16	NC_013194	GTT	2	6	757	762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257091664
17	NC_013194	ACT	3	9	870	878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257091664
18	NC_013194	CAG	2	6	899	904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257091664
19	NC_013194	CTA	2	6	928	933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257091664
20	NC_013194	TCGC	2	8	934	941	0 %	25 %	25 %	50 %	257091664
21	NC_013194	CTC	2	6	953	958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257091664
22	NC_013194	TTC	2	6	971	976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257091664
23	NC_013194	T	8	8	1004	1011	0 %	100 %	0 %	0 %	257091664
24	NC_013194	AAC	2	6	1041	1046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257091664
25	NC_013194	GAA	2	6	1072	1077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257091664
26	NC_013194	AAG	3	9	1175	1183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257091664
27	NC_013194	CGA	3	9	1207	1215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257091664
28	NC_013194	AAG	2	6	1277	1282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257091664
29	NC_013194	GA	3	6	1311	1316	50 %	0 %	50 %	0 %	257091664
30	NC_013194	ACA	2	6	1386	1391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257091664
31	NC_013194	AGA	2	6	1395	1400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257091664
32	NC_013194	AAG	2	6	1445	1450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257091664
33	NC_013194	GGCG	2	8	1544	1551	0 %	0 %	75 %	25 %	257091664
34	NC_013194	ACC	2	6	1559	1564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257091664
35	NC_013194	TGC	2	6	1566	1571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091664
36	NC_013194	CGA	2	6	1588	1593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257091664
37	NC_013194	ACG	2	6	1623	1628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257091664
38	NC_013194	TGG	2	6	1698	1703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013194	CTT	2	6	1872	1877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257091665
40	NC_013194	CTG	2	6	1899	1904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091665
41	NC_013194	TCG	2	6	1930	1935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091665
42	NC_013194	CA	3	6	1944	1949	50 %	0 %	0 %	50 %	257091665
43	NC_013194	TGC	2	6	1969	1974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091665
44	NC_013194	AG	3	6	1981	1986	50 %	0 %	50 %	0 %	257091665
45	NC_013194	GC	3	6	2083	2088	0 %	0 %	50 %	50 %	257091665
46	NC_013194	CGA	2	6	2147	2152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257091665
47	NC_013194	GGCA	2	8	2171	2178	25 %	0 %	50 %	25 %	257091665
48	NC_013194	GAC	2	6	2211	2216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257091665
49	NC_013194	GA	3	6	2242	2247	50 %	0 %	50 %	0 %	257091665
50	NC_013194	AAG	2	6	2250	2255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257091665
51	NC_013194	CTA	2	6	2330	2335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257091665
52	NC_013194	CACCGA	2	12	2519	2530	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	257091665
53	NC_013194	TGT	2	6	2660	2665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257091665
54	NC_013194	CTG	2	6	2682	2687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091665
55	NC_013194	GAT	2	6	2696	2701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257091665
56	NC_013194	CCGCG	2	10	2702	2711	0 %	0 %	40 %	60 %	257091665
57	NC_013194	GGCA	2	8	2756	2763	25 %	0 %	50 %	25 %	257091665
58	NC_013194	GGC	2	6	2777	2782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257091665
59	NC_013194	GAA	2	6	2796	2801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257091665
60	NC_013194	AGG	2	6	2806	2811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257091665
61	NC_013194	CTG	2	6	2868	2873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091665
62	NC_013194	AAC	2	6	2883	2888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257091665
63	NC_013194	GAC	2	6	2895	2900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257091665
64	NC_013194	ACG	2	6	2920	2925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257091665
65	NC_013194	CTG	2	6	2940	2945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091665
66	NC_013194	AC	3	6	3046	3051	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_013194	ACG	2	6	3090	3095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257091666
68	NC_013194	CAC	2	6	3185	3190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257091666
69	NC_013194	GTC	2	6	3203	3208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091666
70	NC_013194	CGA	2	6	3220	3225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257091666
71	NC_013194	GGCC	2	8	3232	3239	0 %	0 %	50 %	50 %	257091666
72	NC_013194	TCA	2	6	3255	3260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257091666
73	NC_013194	CGA	2	6	3328	3333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257091666
74	NC_013194	GCC	2	6	3356	3361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257091666
75	NC_013194	TGC	2	6	3378	3383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091666
76	NC_013194	CGG	2	6	3388	3393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257091666
77	NC_013194	TCAA	2	8	3399	3406	50 %	25 %	0 %	25 %	257091666
78	NC_013194	GGT	2	6	3425	3430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257091666
79	NC_013194	GGT	2	6	3471	3476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257091666
80	NC_013194	CGC	2	6	3491	3496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257091666
81	NC_013194	AAG	2	6	3503	3508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257091666
82	NC_013194	CGT	2	6	3535	3540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091666
83	NC_013194	CGC	2	6	3579	3584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257091666
84	NC_013194	GTC	2	6	3590	3595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091666
85	NC_013194	GCA	2	6	3596	3601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257091666
86	NC_013194	CGA	2	6	3637	3642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257091666
87	NC_013194	ATC	2	6	3677	3682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257091666
88	NC_013194	AGG	3	9	3756	3764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257091666
89	NC_013194	TTC	2	6	3825	3830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257091666
90	NC_013194	GCG	2	6	3852	3857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257091666
91	NC_013194	CGG	2	6	3861	3866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257091666
92	NC_013194	G	6	6	3865	3870	0 %	0 %	100 %	0 %	257091666
93	NC_013194	GTGCT	2	10	3929	3938	0 %	40 %	40 %	20 %	257091666
94	NC_013194	AAC	2	6	3944	3949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257091666
95	NC_013194	TGCG	2	8	3987	3994	0 %	25 %	50 %	25 %	257091666
96	NC_013194	GAA	2	6	4025	4030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257091666
97	NC_013194	AAG	2	6	4043	4048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257091666
98	NC_013194	TGA	2	6	4069	4074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257091666
99	NC_013194	TCG	2	6	4157	4162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091666
100	NC_013194	CGG	2	6	4173	4178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257091666
101	NC_013194	GTC	2	6	4187	4192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091666
102	NC_013194	GCG	2	6	4193	4198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257091666
103	NC_013194	ATC	2	6	4256	4261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257091666
104	NC_013194	GCG	2	6	4265	4270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257091666
105	NC_013194	GC	3	6	4286	4291	0 %	0 %	50 %	50 %	257091666
106	NC_013194	GA	4	8	4297	4304	50 %	0 %	50 %	0 %	257091666
107	NC_013194	CGG	2	6	4413	4418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257091666
108	NC_013194	ACC	2	6	4602	4607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257091666
109	NC_013194	ATC	2	6	4613	4618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257091666
110	NC_013194	CCGATG	2	12	4623	4634	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257091666
111	NC_013194	CTG	3	9	4658	4666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091666
112	NC_013194	TCT	2	6	4671	4676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257091666
113	NC_013194	AAC	2	6	4875	4880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257091666
114	NC_013194	CCT	2	6	4894	4899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257091666
115	NC_013194	TGA	2	6	5025	5030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257091666
116	NC_013194	GCA	2	6	5040	5045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257091666
117	NC_013194	GC	3	6	5066	5071	0 %	0 %	50 %	50 %	257091666
118	NC_013194	TGA	2	6	5146	5151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257091666
119	NC_013194	TCT	2	6	5155	5160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257091666
120	NC_013194	GCG	2	6	5166	5171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257091666
121	NC_013194	CGG	2	6	5193	5198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257091666
122	NC_013194	GTC	2	6	5231	5236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091666
123	NC_013194	GTGC	2	8	5237	5244	0 %	25 %	50 %	25 %	257091666
124	NC_013194	GAA	2	6	5248	5253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257091666
125	NC_013194	CAG	2	6	5263	5268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257091666
126	NC_013194	AGCA	2	8	5318	5325	50 %	0 %	25 %	25 %	257091666
127	NC_013194	GCG	2	6	5392	5397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257091666
128	NC_013194	TCT	2	6	5398	5403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257091666
129	NC_013194	CGA	2	6	5434	5439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257091666
130	NC_013194	GCCGC	2	10	5473	5482	0 %	0 %	40 %	60 %	257091666
131	NC_013194	GCC	2	6	5507	5512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257091666
132	NC_013194	GC	3	6	5643	5648	0 %	0 %	50 %	50 %	257091667
133	NC_013194	GAA	2	6	5649	5654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257091667
134	NC_013194	ATC	2	6	5658	5663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257091667
135	NC_013194	CGG	2	6	5674	5679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257091667
136	NC_013194	GC	3	6	5691	5696	0 %	0 %	50 %	50 %	257091667
137	NC_013194	AGC	2	6	5742	5747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257091667
138	NC_013194	GCC	2	6	5909	5914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257091667
139	NC_013194	GAT	2	6	5939	5944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257091667
140	NC_013194	TGC	2	6	6061	6066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091667
141	NC_013194	CAC	2	6	6073	6078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257091667
142	NC_013194	TGG	2	6	6117	6122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257091667
143	NC_013194	GATC	2	8	6127	6134	25 %	25 %	25 %	25 %	257091667
144	NC_013194	GCG	2	6	6165	6170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257091667
145	NC_013194	AGC	2	6	6193	6198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257091667
146	NC_013194	CGA	2	6	6220	6225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257091667
147	NC_013194	TGC	2	6	6261	6266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091667
148	NC_013194	GC	3	6	6281	6286	0 %	0 %	50 %	50 %	257091667
149	NC_013194	AAG	2	6	6311	6316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257091667
150	NC_013194	GGC	2	6	6335	6340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257091667
151	NC_013194	GC	3	6	6339	6344	0 %	0 %	50 %	50 %	257091667
152	NC_013194	AGA	2	6	6375	6380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_013194	GCA	2	6	6392	6397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_013194	ATG	2	6	6436	6441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_013194	CCGCT	2	10	6442	6451	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
156	NC_013194	CTG	2	6	6455	6460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_013194	GGC	2	6	6486	6491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_013194	GCC	2	6	6503	6508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
159	NC_013194	A	6	6	6560	6565	100 %	0 %	0 %	0 %	257091668
160	NC_013194	TGC	2	6	6642	6647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091668
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162	NC_013194	GCG	2	6	6740	6745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257091668
163	NC_013194	ATCG	2	8	6802	6809	25 %	25 %	25 %	25 %	257091668
164	NC_013194	CGG	2	6	6863	6868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257091668
165	NC_013194	TCG	2	6	6921	6926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091668
166	NC_013194	GCG	2	6	6942	6947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257091668
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169	NC_013194	GTTTG	2	10	7000	7009	0 %	60 %	40 %	0 %	257091668
170	NC_013194	GACC	2	8	7037	7044	25 %	0 %	25 %	50 %	257091668
171	NC_013194	CAAGA	2	10	7184	7193	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
172	NC_013194	CGA	2	6	7242	7247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_013194	TGT	2	6	7251	7256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
174	NC_013194	TGA	2	6	7284	7289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
175	NC_013194	AGCA	2	8	7309	7316	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
176	NC_013194	CGC	2	6	7317	7322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
177	NC_013194	CGGCG	2	10	7400	7409	0 %	0 %	60 %	40 %	257091669
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195	NC_013194	GCGCC	2	10	8251	8260	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
196	NC_013194	GCC	2	6	8286	8291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
197	NC_013194	T	6	6	8339	8344	0 %	100 %	0 %	0 %	257091670
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233	NC_013194	GGT	2	6	9867	9872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257091671
234	NC_013194	TCG	2	6	10046	10051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091671
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250	NC_013194	CAG	2	6	10532	10537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257091672
251	NC_013194	GCG	2	6	10541	10546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257091672
252	NC_013194	CGGC	2	8	10601	10608	0 %	0 %	50 %	50 %	257091672
253	NC_013194	AAG	2	6	10614	10619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257091672
254	NC_013194	CCT	2	6	10677	10682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257091673
255	NC_013194	TCG	2	6	10694	10699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091673
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258	NC_013194	GGC	2	6	10735	10740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257091673
259	NC_013194	GGCGC	2	10	10746	10755	0 %	0 %	60 %	40 %	257091673
260	NC_013194	CGC	2	6	10785	10790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257091673
261	NC_013194	GCC	2	6	10801	10806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257091673
262	NC_013194	CGC	2	6	10838	10843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257091673
263	NC_013194	GCT	2	6	10864	10869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091673
264	NC_013194	CG	3	6	10940	10945	0 %	0 %	50 %	50 %	257091673
265	NC_013194	GGC	2	6	10962	10967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257091673
266	NC_013194	TCG	2	6	10976	10981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091673
267	NC_013194	TCG	2	6	11010	11015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091673
268	NC_013194	TGG	2	6	11029	11034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
269	NC_013194	GCGG	2	8	11082	11089	0 %	0 %	75 %	25 %	257091674
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378	NC_013194	CGA	2	6	15045	15050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257091677
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381	NC_013194	GCG	2	6	15139	15144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
382	NC_013194	CGC	2	6	15163	15168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
383	NC_013194	TCG	2	6	15172	15177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
384	NC_013194	G	7	7	15185	15191	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
385	NC_013194	GCC	2	6	15196	15201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257091678
386	NC_013194	GC	4	8	15208	15215	0 %	0 %	50 %	50 %	257091678
387	NC_013194	TCG	2	6	15289	15294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257091678
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391	NC_013194	AGC	2	6	15517	15522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257091678
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